Muitos fungos podem sobreviver em associações com outros seres vivos, podendo ser uma interação harmônica ou não. Como exemplo dessa relação podemos citar
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Os líquens, que são associações entre fungos e algas ou fungos e cianobactérias.
Outro exemplo são as micorrizas, uma associação entre fungos e raízes de plantas.
Tais relações de associação são chamadas de mutualismo e as espécies envolvidas têm vantagens e a sobrevivência de uma depende da outra.
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