Question

Se eu pegar os arquivos de um pendrive e passar para a segunda partição de um HD e trocar de SO, os arquivos do pendrive que estavam na partição 2 do hd somem?

Answer 1

Partições tem seus armazenamentos independentes uma das outras. É justamente para isto que servem.

Se o SO estiver na partição "A" e seus dados na partição "B", ao formatar a partição "A" nada acontece com a "B". Os dados da "B" são mantidos intactos.

Só cuidado na hora de formatar para não selecionar a partição errada ou deletar a de dados sem querer.