Question

qual a razao do conflito entre jesuitas e colonos?

Answer 1

os colonos queriam escravizar, exterminar, estuprar etc., as populações indígenas... 
os jesuítas, ao contrário, queriam defender e se comunicar com as populações indígenas, eles instruíam os indígenas para se defenderem dos colonos... os jesuítas sempre foram a ordem católica mais séria, mais sóbria, mais científica - por sua ética em defender os fracos e oprimidos, e por manter relações amistosas com diversas culturas, sempre foram bastante odiados pela elite e por seus capangas, que sempre achavam que os povos que não fossem de cultura européia eram meros animais. 
Espero ter ajudado