Question

Os genomas de vários seres vivos estão disponíveis em bancos de dados públicos, como o GenBank, mantido e administrado pelo National Institutes of Heath dos Estados Unidos, que possui todas as sequências genômicas publicamente disponíveis. Mas como as sequências do mapeamento genético são obtidas? Para obtermos genomas completos de indivíduos, basicamente devemos realizar algumas etapas para o estudo, analise-as: 1- Desnaturar a molécula do DNA, descondensar as fitas e clivar o genoma em várias sequências aleatórias, com auxílio de enzimas de restrição. 2- Analisar com ferramentas computacionais as sequências onde há superposição de nucleotídeos, onde as sequências se sobrepõem, chamadas de sequências contigs. 3- Analisar a superposição dos pedaços maiores da fita, até que todos os pequenos fragmentos sejam unificados, obtendo-se uma sequência de consenso, onde há uma concordância entre os fragmentos e se obtém a montagem da fita completa de DNA. 4- Realizar o sequenciamento das sequências aleatórias. Assinale a opção que representa a ordem correta das etapas de estudo para obtenção do genoma completo de indivíduos:

Answer 1

1-4-2-3 é a ordem correta para estas etapas relacionadas ao processo de obtenção de sequências genômicas.

Extração e sequenciamento do material genético

Para a obtenção de dados genéticos na forma de sequência de nucleotídeos temos três principais etapas:

• Extração e preparação do DNA: o material genético é obtido a partir de amostras do organismo através da extração do DNA, que na sequência será desnaturado, limpado e purificado;
• Amplificação do DNA: utilização de técnicas como o PCR para produzir diversos fragmentos da região do DNA na qual temos interesse;
• Sequenciamento: por fim, o material genético será lido e informatizado na forma de sequencia de nucleotídeos.

Considerando que estas etapas seguem necessariamente esta ordem, agora vamos associar as afirmações da questão a cada etapa:

• A assertiva 1 está relacionada a etapa de extração e preparação do DNA;
• As assertivas 2, 3 e 4 se referem ao processo de sequenciamento.

Assim, sabemos que a assertiva 1 é a primeira etapa dentre as citadas no enunciado. Considerando as demais assertivas:

• A assertiva 4 fala sobre obter sequências aleatórias, ou seja, as primeiras sequências. Esta é a parte inicial do processo de sequenciamento, logo ela é a próxima assertiva;
• Na sequência deveríamos realizar um alinhamento das sequências obtidas, para obtenção da sequência de consenso. Isto é contextualizado na assertiva 3, que será a próxima da sequência;
• Por fim se realizará o alinhamento entre as sequências obtidas a partir do processo anterior, o que está definido na assertiva 2.

Assim, concluímos que a ordem correta das assertivas é 1, 4, 3, 2.

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