Question

porque é muito difícil determinar relação de sequência de base mitrogenada nos virus

Answer 1

Depende do tipo de vírus. Nos adenovírus (material genético é o DNA), a proporção das bases nitrogenadas é A=T e C=G, já que a fita de DNA é dupla. 
Nos retrovírus (vírus de RNA) a proporção não é necessariamente igual, pois o RNA possui fita simples, lembrando que possui uracila ao invés de timina.