Question

porque as bactérias que vivem no intestino das pessoas passaram a causar a morte delas

Answer 1

Porque as bactérias mesmo sendo de um tamanho insignificante afetam nossos órgãos, há algumas bactérias que são boas que ajudam a despertar nosso sistema imulógico, que defende nosso corpo de outras bactérias invasoras essas que podem causar a morte, não só as bactérias que vivem no intestino mais em todo o corpo, algumas que vivem no intestino podem causar diarréia e outras doenças.
Para estar com um intestino funcionando bem e alimentarmos as bactérias boas, precisamos consumir alimentos "prebióticos".
Com isso a população de bactérias que vivem no nosso corpo conhecida como " microbiota" fica em harmonia. 
As bactérias "ruins" podem fazer o nosso intestino infartar, como o coração, esse problema é grave e pode até matar se não for socorrida rapidamente, quando o intestino infarta ele para de receber sangue e necrosa, ai é preciso fazer uma cirurgia para retirada de uma parte do intestino. 
Espero ter ajudado. :)