Question

por que os burgueses queriam liberdade de comércio

Answer 1

O liberalismo econômico, derivado do liberalismo clássico (vale lembrar que não são a mesma coisa), surgiu num momento em que a burguesia já tinha importante papel na sociedade. 
O liberalismo clássico prega, entre outros (e de forma resumida) a diminuição ou desconcentração do poder das mãos do governo, ou seja, o governo deveria se limitar a cumprir suas funções, deixando os cidadãos usufruírem o máximo possível de suas liberdades individuais. 
O liberalismo econômico se baseou nessas idéias (originalmente pensadas no campo da política) e as transportou para a economia. 
Naquela época ainda havia grande controle do governo na economia. O liberalismo econômico (chamado por Sartori de "liberismo") queria também desconcentrar o poder de decisão na economia das mãos do governo (ou seja, também seguia a linha de diminuir o poder do governo em benefício dos cidadãos). 
Isso beneficiou a burguesia no sentido de que, a partir do momento em que o controle do governo sobre a economia foi diminuído, ela teve mais espaço para crescer e se consolidar como força econômica e política, já que não dependia mais do governo para obter resultados, e sim do mercado (que deveria ser livre, segundo o "liberismo"). 
Vale ressaltar, por curiosidade, que o liberalismo clássico, ou seja, o liberalismo político surgiu na Inglaterra numa época de turbulências políticas, num processo que levaria à decadência do poder Real absoluto e à ascensão do Parlamento, que assumiria as funções de governo no lugar da Coroa (governo civil). 
Sobre algumas das fontes abaixo, se tiver qualquer erro de referência, te escrevo corrigindo.