Question

Por que na forma negativa da frase "Does she like pizza" fica "She does not like pizza" Porque o "not" esta depois do Does

Answer 1

Pois na formação da frase vem primeiro o auxiliar (does) e depois caso queira negar o auxiliar de negação (not) 

Answer 2

porque numa frase negative (que não seja uma pergunta) a partícula de negação, ou seja, o NOT, vem imediatamente após os verbos auxiliares, no caso da sua frase o DOES.

1) she DOES NOT like pizza (forma completa)
2) she DOESN'T like pizza (forma abreviada)

Agora, cuidado com o formato negativo em uma pergunta, pois existem 2 possibilidades distintas em posicionamento do NOT:

1) Doesn't she like pizza ??? (ae tu tá usando a forma abreviada)
2) Does she not like pizza ??? (quando tu usa a forma completa o NOT, necessariamente vem depois do sujeito)