Na tentativa de explicar a origem dos seres vivos, Müller reproduziu, em seu experimento, as condições atmosféricas primitivas, que continham os gases metano (CH4); amônia (NH3); gás hidrogênio (H2) e vapor de água (H2O). Esses quatro compostos apresentam, respectivamente, estruturas com geometria molecular:
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Geometria do Metano: tetraédrica
Amônia: piramidal
Gás Hidrogênio: linear
Vapor de água: angular
Amônia: piramidal
Gás Hidrogênio: linear
Vapor de água: angular
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