Question

de acordo com os atos institucionais qual era o tratamento dispensado pelo governo militar na época que as pessoas discordavam dos seus atos?

Answer 1

Durante o regime militar, foram elaborados 17 Atos Institucionais(pode ser abreviado para AI). Só que, geralmente a gente aprende os que tiveram impactos considerados muito grandes: como o AI-1, AI-2 e o AI-5. Vamos lá por que é importante entender o AI-1? Esse Ato Institucional fez com que o poder Executivo tivesse mais força política e reduziu o campo de ação do Congresso, que faz parte do poder Legislativo. Mas, o Congresso continuou aberto e funcionando (na verdade, durante o governo militar, o Congresso permaneceu mais tempo aberto do que fechado, mas ,mesmo assim, ele tinha muitas limitações). Já o AI-2 determinou que somente dois partidos políticos podiam existir na legalidade: a Aliança Renovadora Nacional(Arena) e o Movimento Democrático Brasileiro (MDB). A Arena era composta pelos membros do governo vigente e o MDB representava uma oposição consentida, ou seja, eles podiam discordar do que o governo fazia mas não tinham muita influência política nas décadas de 60 e 70, principalmente. O AI-5 representou a chegada da Linha Dura no poder, quem decretou foi um presidente chamado Costa e Silva, mas quem ficou mais tempo colocando em prática essa medida foi o presidente Médici. O AI-5 suspendeu os partidos políticos, fechou o Congresso, representou o apogeu de torturas, assassinatos, censura prévia, por exemplo, então quem não concordasse com o governo não podia se expor muito, porque corria esses riscos. Então, durante  o período da ditadura militar,  houve perseguição aos opositores do regime, de forma escancarada ou não.
Pelo que vi você está no ensino fundamental. Tenha atenção quando você chegar no no ensino médio, porque esse é um assunto no qual tem professores que preferem ficar enaltecendo ou o lado dos opositores da ditadura ou dos militares, aí você fica sabendo a história meio que "pela metade". 
Bons estudos :)