A versão do Java voltada para desktops e servidores e a versão voltada para aplicativos de rede em geral são, respectivamente:
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Java SE(Standart edition) é a versão para desktop;
Java EE(Enterprise edition) é a versão para web services, contudo, o Java SE e o Java EE estão interligados em servidores locais, na grande maioria das vezes, estando separados apenas quando o servidor é usado por empresas de maior porte, etc.
Java ME(micro edition) é o Java utilizado em dispositivos móveis, e outros aparelhos do tipo, como Pager.
Espero ter ajudado.
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