A composição orgânica serve como fonte de alimento para os microorganismos, no qual ocorre reações químicas como troca iônica e influencia a propriedade física do solo. Alguns compostos orgânicos podem contribuir para o intemperismos de que gerará material mineral.
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A matéria orgânica desempenha uma função primordial no solo, pois possibilita melhorias de estrutura e aeração, retenção de umidade, incorporação de nutrientes como nitrogênio, enxofre e outros, além do aumento do tamponamento do solo. Ela apresenta constituição lábeis e estáveis. Esta divisão é baseada na taxa de decomposição e permite compreender melhor a dinâmica da matéria orgânica no solo. A matéria orgânica lábil é constituída pelos resíduos de plantas em decomposição, substâncias não-húmicas não ligadas aos constituintes minerais, formas solúveis em água, macrorganismos (fauna) e biomassa microbiana. A mineralização dos componentes lábeis ocorre rapidamente (semana ou meses). Já os componentes estáveis (substâncias húmicas e outras macromoléculas) são bem mais resistentes ao ataque microbiano, em função da sua estrutura molecular e da proteção física
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